Ich glaube, dass ich es langsam verstehe. Der Mesa Treiber aus dem Repo ist aktueller als der Mesa, den Steam hat. Ich habe gerade das angemeckerte Paket per "sudo dnf remove" vom Rechner geputzt und alle Abhängigkeiten mitgenommen. Da ist auch Steam drunter.
Anschließend läuft das Update fehlerfrei durch und alles ist gut. Installiere ich jetzt Steam wieder aus dem Package Manager, will Steam ein Downgrade des Mesa Treibers machen.
Für mich sieht es danach aus, dass das Steam Paket ein Update benötigt, um mit dem aktuellen Mesa Treiber zu arbeiten.