Wenn er sie mit Timeshift gesichert hat braucht man zum Wiederherstellen kein Timeshift. Timeshiftlegt doch die Sicherungen in einer ganz normalen Ordnerstrucktur ab. Man kann einfach zurück kopieren.
Ich vermute aber, dass auch bei dir /boot/efi ein Mountpoint ist, auf die extra efi partition zeigt und damit nicht einfach zurück kopierbar ist. Ob es im BIOS Fall genauso ist - keine Ahnung.