bubba du kannst die Starter die du Anpassen willst einfach von /usr/share/applications/ nach /home/username/.local/share/applications/ kopieren. Wichtig ist das der Dateiname gleich bleibt.
Also wenn der Dateiname libreoffice-calc.desktop ist muss es nachher auch so heissen. Wenn es zwei Starter mit dem selben Namen in beiden Ordner gibt übernimmt das System der Starter aus dem Nutzerordner und ignoriert den im Systemordner.