Hätte jetzt dazu geraten, sie via LVM zu poolen. Aber durch die Unterschiede in der Geschwindigkeit und Bauart vielleicht nicht die beste Idee. Dann eher beide mit LUKS verschlüsseln und eine als / und eine als /home. Oder - falls du nicht immer auf viel Speicher angewiesen bist - einfach die HDD in einem Ordner unterhalb von /home.
Was ist denn, wenn du einfach 40 EUR für ne MX500 oder EVO 860 investierst und dann beide SSD einfach doch als verschlüsselte VG (LVM) betreibst?