aber dann hattest Du auch bestimmt ein Treiber oder Software für den Lüfter installiert gehabt, die fehlt Dir natürlich jetzt unter Linux.
Wenn sie nicht mit dem Mainboard verbunden sind, braucht's doch auch keine Treiber. Sicher das die FB noch geht bzw. Batterien nicht leer sind?
Für mich hört sich das nach einem Autarken System an, welches mit Linux nichts zu tun hat.