hallo harihegen, von mir auch ein schuss ins blaue 
in den Grundeinstellungen als Admin, kannst Du zwischen 3 Arten der Hintergrunddienste
auswählen.
Ich bin mir nicht sicher, aber wenn Du dort mal entweder AJAX oder CRON auswählst
um zu testen, wie sich es dann verhält? Einfach mal probieren, ob es dann besser
läuft. Kann ja sein, das einer der Dienste Probleme bereitet.
Dann ist mir noch eingefallen, dass es vielleicht auch eine aktivierter App sein kann.
Vielleicht mal, wenn es nicht so viele sind, alle deaktivieren, dann nach einander
aktivieren und schauen, ob das Problem bei einer speziellen App auftritt.