Die Tuxedo Leute stellen die Änderungen alle Upstream zur Verfügung, jedoch dauert die Umsetzung so lange, dass es dann eben einfacher war Tuxedo OS zu bauen und zu veröffentlichen.
Es sind viele Kleinigkeiten, die anders sind als bei Ubuntu, mehr dazu hier
Was unterscheidet TUXEDO OS 1 von Ubuntu/Kubuntu? - TUXEDO Computers