Hmm, habe mir jetzt den Thread ein paar mal durch gelesen, konnte aber nicht erkennen ob du Linux und Win jeweils auf eine extra Platte /SSD installiert hast.
Ich würde es auf jeden Fall so machen und dann mit den F-Tasten beim Booten auswählen von welcher UEFI-Platte gebootet werden soll.
Wie gelesen habe soll es ja für dich kein Problem sein zwei Speicherplatten einzubauen.
LG