Ich hab nur minimale Erfahrung mit PrestaShop, aber laut Doku kann das von Haus aus CSV-Dateien einlesen. Andere Shop-Software kenn ich nicht wirklich. Bei AlternativeTo (für Alternativen zu z.B. Shopware) könntest du auch nachschauen oder bei Shopify & Co., sollte sowas in Frage kommen.