Es kommt darauf an ob Dateirechte von Bedeutung sind.
Die kann man auch "übersetzen", aber dann wirds richtig lustig.
Beiträge von Currock im Thema „Welche Formatierung“
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Für ext2 bis ext4 gibt es inzwischen auch Erweiterungen für Windows. Sonst für ältere Windows-Versionen NTFS, für neuere exFAT.
Ich würde mich danach richten, wie oft ich von wo aus auf das Laufwerk zugreife.