Ziehe mal beide Grafikkarten raus und boote mal nur mit der Onboard und schau ob es schneller geht.
Danach die Eine oder Andere rein und prüfen, vielleicht braucht die Erkennung zu lange welche Primär oder Sekundär ist...
Auch würde ich zur Fehlersuche alle Geräte die nicht gebraucht werden zunächst abstecken um Fehlerquellen zu vermeiden. So kannst du es langsam einkreisen...
Da steckt nur eine Karte drin. Die andere ist die GPU Einheit im Prozessor.